★魚類の分類と進化
以前は魚上綱（ぎょじょうこう）として1 つの綱に分類されていた。
魚上綱とは、軟骨魚綱、硬骨魚綱、絶滅した板皮綱および棘魚綱の4 の綱から構成される巨大な分類群であった。
しかし、以下の理由から現在ではあまり用いられず、また分類学上も使用は好ましくないとされる。
新分類では、脊椎動物亜門の下に無顎上綱と顎口上綱を設け、そこ
魚類および四肢動物を含める。
生物の進化の歴史では、脊椎動物の中で無顎類が最も古く生まれ、次いで顎口類の魚が現れたと推定されている。また、魚類からは四肢動物（両生類、爬虫類、鳥類、哺乳類）が分岐して生まれている。すなわち魚上綱と呼ばれる生物のグループは側系統群（単系統群から一部の群を除いたグループ）である。
板皮階:en:Placodermiomorphi|Placodermiomorphi（絶滅種）
*板皮綱 Placodermi
軟骨魚階（軟骨魚類） :en:Chondriomorphi|Chondriomorphi
*軟骨魚綱w:Chondrichthyes|Chondrichthyes
**全頭亜綱w:Holocephali|Holocephali
***ギンザメ目]] Chimaeriformes - ギンザメ
**板鰓亜綱w:Elasmobranchii|Elasmobranchii
***ネコザメ目 Heterodontiformes - ネコザメ
***テンジクザメ目 Orectolobiformes - ジンベエザメ、トラフザメ
***ネズミザメ目 Lamniformes - ホホジロザメ、ネズミザメ、ミツクリザメ、メガマウス、ウバザメ
***メジロザメ目 Carcharhiniformes - ヨシキリザメ、シュモクザメ、メジロザメ、オオメジロザメ
***カグラザメ目 Hexanchiformes -カグラザメ、ラブカ
***キクザメ目 Echinorhiniformes - キクザメ
***ツノザメ目 Squaliformes - ツノザメ
***カスザメ目 Squatiniformes - カスザメ
***ノコギリザメ目 Pristiophoriformes - ノコギリザメ
***シビレエイ目 Torpediniformes - シビレエイ
***ノコギリエイ目 Pristiformes - ノコギリエイ
***アカエイ目 Rajiformes - アカエイ
***トビエイ目 Myliobatiformes -オニイトマキエイ(マンタ)
◆真口階（硬骨魚類）[:en:Teleostomi|Teleostomi
*棘魚類|棘魚綱[:en:Acanthodii|Acanthodii （絶滅）
*肉鰭綱 w:Sarcopterygii|Sarcopterygii
**シーラカンス|シーラカンス亜綱:Coelacnathimorpha|Coelacnathimorpha
***シーラカンス目 Coelacanthiformes - シーラカンス（ラティメリア）
**ハイギョ|ハイギョ亜綱 w:Dipnotetrapodomorpha|Dipnotetrapodomorpha
***ケラトドゥス目 Ceratodontiformes - オーストラリアハイギョ（ネオケラドトゥス）
*条鰭綱 [[w:Actinopterygii|Actinopterygii
**Subclass w:Cladistia|Cladistia
***ポリプテルス目 Polypteriformes - ポリプテルス、アミメウナギ]]
**[[軟質亜綱]] [[w:Chondrostei|Chondrostei]]
***チョウザメ目 Acipenseriformes - チョウザメ
**新鰭亜綱 w:Neopterygii|Neopterygii
***ガー目 Lepisosteiformes -ガー
***アミア目 Amiiformes - アミア
***真骨類 w:Teleostei|Teleostei
****Order Hiodontiformes
****アロワナ目 Osteoglossiformes - アロワナ、ピラルクー
****カライワシ目 Elopiformes -カライワシ
****ソトイワシ目 Albuliformes - ソトイワシ
****ウナギ目 Anguilliformes - ウナギ、マアナゴ、ウツボ
****フウセンウナギ目]] Saccopharyngiformes
****ニシン目 Clupeiformes - マイワシ、ニシン、コノシロ
****ネズミギス目 Gonorynchiformes - ネズミギス、サバヒー
****コイ目 Cypriniformes
*****ドジョウ亜目 Cobitoidea - ドジョウ、クーリーローチ
*****コイ亜目 Cyprinoidea - コイ、フナ
****カラシン目 Characiformes - ピラニア、テトラ
****ナマズ目 Siluriformes - ナマズ
****デンキウナギ目 Gymnotiformes - デンキウナギ
****ニギス目 Argentiniformes -ニギス
****キュウリウオ目 Osmeriformes -アユ
****サケ目 Salmoniformes - サケ類
****カワカマス目 Esociformes -カワカマス（パイク）
****ワニトカゲギス目 Stomiiformes
****シャチブリ目 Ateleopodiformes
****ヒメ目 Aulopiformes - エソ
****ハダカイワシ目 Myctophiformes - ハダカイワシ
****アカマンボウ目 Lampriformes - アカマンボウ、リュウグウノツカイ
****ギンメダイ目 Polymixiiformes -ギンメダイ
****サケスズキ目 Percopsiformes - サケスズキ
****タラ目 Gadiformes - マダラ、スケトウダラ
****アシロ目 Ophidiiformes - イタチウオ
****ガマアンコウ目 Batrachoidiformes
****アンコウ目 Lophiiformes - アンコウ、チョウチンアンコウ
****ボラ目 Mugiliformes - ボラ
****トウゴロウイワシ目 Atheriniformes - トウゴロウイワシ
****ダツ目 Beloniformes - サンマ、トビウオ、メダカ
****カダヤシ目 Cyprinodontiformes - グッピー、ヨツメウオ
****クジラウオ目 Stephanoberyciformes - クジラウオ
****キンメダイ目 Beryciformes - キンメダイ
****マトウダイ目 Zeiformes - マトウダイ
****トゲウオ目 Gasterosteiformes - イトヨ、タツノオトシゴ、ヨウジウオ
****タウナギ目 Synbranchiformes - タウナギ
****カサゴ目 Scorpaeniformes
*****セミホウボウ亜目 Dactylopteroidei - セミホウボウ
*****カサゴ亜目 Scorpaenoidei - カサゴ、メバル、オコゼ
*****コチ亜目 Platycephaloidei - マゴチ
*****ギンダラ亜目]] Anoplopomatoidei - ギンダラ
*****アイナメ亜目 Hexagrammoidei - アイナメ、ホッケ
****カジカ亜目 Cottoidei - カジカ
****スズキ目 Perciformes
*****スズキ亜目 Percoidei - スズキ (魚)|スズキ、マダイ
****アジ亜目 Carangoidei - マアジ、ブリ
*****ベラ亜目 Labroidei - ベラ、スズメダイ、クマノミ
*****ゲンゲ亜目 Zoarcoidei
*****ワニギス亜目 Trachinoidei - ハタハタ
*****ギンポ亜目 Blennioidei - ギンポ、ナベカ
*****ウバウオ亜目 Gobiesocoidei
*****ネズッポ亜目 Callionymoidei - コチ、ネズミゴチ
*****ハゼ亜目 Gobioidei - ハゼ
*****ニザダイ亜目 Acanthuroidei - アイゴ、ニザダイ
*****サバ亜目Scombroidei - [サバ、カツオ、マグロ
*****イボダイ亜目 Stromateoidei - イボダイ、ナガツオ
*****キノボリウオ亜目 Anabantoidei - ベタ、キノボリウオ
*****タイワンドジョウ亜目 Channoidei - ライギョ
****カレイ目 Pleuronectiformes
*****ボウズガレイ亜目 Psettodoidei - ボウズガレイ
*****カレイ亜目 Pleuronectoidei - ヒラメ、マコガレイ
*****ウシノシタ亜目 Soleoidei -ササウシノシタ
****フグ目 Tetraodontiformes
*****モンガラカワハギ亜目 Balistoidei - カワハギ、ハコフグ
*****フグ亜目 Tetraodontoidei - トラフグ、マンボウ
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